Berdasarkan UU/39/1999 :Pasal 76 Perwakilan Komnas HAM dapat didirikan di daerah. Saat ini telah berdiri 5 perwakilan Komnas ham di: Sumatera Barat, Kalimantan Barat, Maluku, Papua dan satu kantor perwakilan di Nanggore Aceh Darussalam.